скорее всего сами порты не различаются, различаются протоколы связи, поддерживаемые железной составляющей (если таковая присутствует, например в мобильном телефоне).
два порта автоматически должны состраиваться друг с другом по протоколу, который поддерживают оба коммутируемых устройства
Lol, думаю, что нет, разницы скорости нет, потому что инфракрасные порты не слишком популярны с точки зрения скорости, скорее их подчеркивают как компактные и бездротовые. Обычно они используются для беспроводного подключения периферийных устройств.